Terjadinya pendangkalan telah mengurangi umur guna Waduk Pacal yang berfungsi sebagai pengendali banjir dan tandon air untuk mengatur kebutuhan air irigasi di kawasan Waduk Pacal. Dalam musim penghujan air akan melimpah dan tidak bisa tertampung di Waduk sedangkan pada musim kemarau debitnya tidak akan mampu mengaliri irigasi dan pada beberapa tahun ini air waduk pada musim kemarau tidak ada sama sekali.
